Natcaféens lederteams primære opgave er at sikre, at de frivillige og de nigerianske kvinder trives i caféen. Lederteamet består af fem frivillige medarbejdere i samarbejde med en projektleder. Teamet er med til at udvikle det værdisæt, der danner rammerne for de frivilliges arbejde, og evaluerer de eksisterende tiltag. Yderligere anvender lederteamet hinanden til vidensdeling og som sparringspartnere med det formål at styrke det relationelle arbejde med de nigerianske kvinder.

Et medlem af lederteamet bibeholder sin eksisterende funktion som frivillig, og tager vagter i caféen hver 3. uge på lige fod med de øvrige frivillige. Lederteamet mødes i gennemsnit hver 2. måned, og er med til at arrangere 4 – 5
årlige møder og sociale arrangementer for de frivillige. Møderne har til hensigt at styrke det sociale sammenhold i frivilliggruppen, og udruster den enkelte med viden, som de kan drage nytte af i deres arbejde i natcaféen.